engleski

Satellite DNAs : secret parts of genomes

Ponavljajući slijedovi DNA imaju veliki udio u eukariotskim genomima, a među njima značajnu frakciju predstavljaju uzastopno ponavljene sekvence ili satelitne DNA (satDNA). Izrazita raznolikost satDNA (glavne DNA komponente u heterokromatinu) u nukleotidnom slijedu, genomskom udjelu te kompleksnosti povlači za sobom nekoliko značajnih pitanja: Koji molekularni mehanizmi mijenjaju profil satDNA u blisko srodnim vrstama? Da li su te promjene podložne selekciji? I naposljetku, zašto bi satDNA bila značajna u genomskoj evoluciji? U traženju odgovora na ova pitanja biti će predstavljene naše komparativne studije evolucije satDNA u organizmima koji imaju različitu heterokromatinsku organizaciju. To su kukci porodice Tenebrionidae koji se razmnožavaju spolno i imaju regionalnu centromeru te partenogenetske vrste oblića roda Meloidogyne s holocentričnim kromosomima. Nadalje, zbog ponovljenih sekvenci koje čine najveći udio u heterokromatinu, ova područja su problematična za kloniranje, sekvenciranje i slaganje genoma u genomskim projektima. To ima za posljedicu da « ; dovršenim » ; genomima nedostaju značajni dijelovi heterokromatina. Genomi kukca vrste Tribolium castaneum i oblića Meloidogyne incognita nedavno su sekvencirani i genomi su objavljeni. Biti će predstavljeni rezulati naše kombinirane in silico i eksperimentalne studije napravljene na ovim genomima koja nudi novo, sveobuhvatno istraživanje strukture i evolucije satDNA u genomima.

genome; satellite DNA

nije evidentirano