hrvatski

Vezanje proteina CTCF na H19 ICR u stanicama Cal27

Protein CTCF (od engl. CCCTC binding factor) ima brojne uloge u regulaciji transkripcije. Ključan je za genomski upis inzulinu sličnog čimbenika rasta 2 (IGF2). Područje H19 ICR (od engl. imprinting control region), između IGF2 i H19, je nemetilirano na majčinom alelu, što omogućava vezanje CTCFa, koji u ADP-riboziliranom obliku sprječava transkripciju IGF2. Metiliranost H19 ICR na očevom alelu onemogućava vezanje CTCFa te je IGF2 ispoljen. Za proučavanje regulacije genomskog upisa IGF2/H19 trebalo je pronaći heterozigotnu staničnu liniju za polimorfizam u CTCF veznom području na H19 ICR. Kromatinskom imunoprecipitacijom sam u stanicama Cal 27 utvrdila bialelno vezanje CTCFa na H19 ICR. Metodom RT-PCR sam pokazala da su i IGF2 i H19 ispoljeni u Cal 27 stanicama. Inhibicija ADP-ribozilacije 3-aminobenzamidom, nije izazvala promjenu u vezanju CTCFa i ispoljavanju IGF2 i H19, što ukazuje na to da osim izolatorske uloge ADP-riboziliranog CTCFa, vezanog na H19 ICR, dodatni mehanizmi reguliraju genomski upis IGF2/H19.

genomski upis; CTCF; polimorfizam; H19 ICR; ADP-ribozilacija; kromatinska imunoprecipitacija

nije evidentirano