hrvatski

Anotacija genskih nakupina poliketida i hibridnih sustava u genomu bakterije Streptomyces scabies

Poliketidi i neribosomalno sintetizirani peptidi su najznačajniji predstavnici sekundarnih metabolita. U zadnje vrijeme sve veću pozornost privlače i hibridni sustavi. Mehanizmi sinteze navedenih sekundarnih metabolita zasnivaju se na enzimskim kompleksima nazvanim poliketid sintaze (PKS) i sintetaze neribosomalnih peptida (NRPS). U biosintezi hibridnih sustava uključeni su enzimski kompleksi obje skupine. Geni čiji enzimi sudjeluju u biosintezi sekundarnih metabolita obično su organizirani u genske nakupine. Cilj ovog diplomskog rada bio je sistematizirati znanje o dosada istraženim i detaljno opisanim biosintetskim mehanizmima sustava PKS i hibrida. Takav pristup trebao bi dovesti do bolje klasifikacije navedenih sekundarnih metabolita. Taj je pristup testiran na novosekvencioniranom i do sada neopisanom genomu bakterije Streptomyces scabies. Osnovni alat koji je upotrijebljen u ovom radu jest bioinformatički programski paket ClustScan razvijen na Prehrambeno-biotehnološkom fakultetu Sveučilišta u Zagrebu.

PKS genske nakupine; hibridne genske nakupine; genom bakterije Streptomyces scabies; računalni programski paket ClustScan

nije evidentirano